7月10日下午，中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心舉辦了“單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)基礎(chǔ)分析流程快速入門”培訓(xùn)，旨在幫助科研人員了解和掌握相關(guān)技術(shù)和工具，以提升自身生物信息分析能力。本次培訓(xùn)由中心資深工程師黃俞瑋擔(dān)任主講人，其研究方向?yàn)樯镄畔W(xué)大數(shù)據(jù)分析和流程搭建，目前主要負(fù)責(zé)單細(xì)胞及空間轉(zhuǎn)錄組方向的分析工作。
黃俞瑋首先向20多位學(xué)員介紹了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)基礎(chǔ)分析的基本概念，包括常用技術(shù)及基本原理、數(shù)據(jù)格式示例及說明、常用量化比對(duì)pipeline、預(yù)處理及細(xì)胞分群pipeline等基礎(chǔ)分析流程的要點(diǎn)。隨后，她詳細(xì)介紹了ViPMAP（https://www.biosino.org/vipmap/home）單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)基礎(chǔ)分析的實(shí)操內(nèi)容，包括網(wǎng)站基礎(chǔ)功能及數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)簡介、基礎(chǔ)分析參數(shù)解析及任務(wù)提交管理，以及分析結(jié)果解讀。
培訓(xùn)過程中，學(xué)員們積極參與，踴躍發(fā)言，并與主講人進(jìn)行了深入的交流和討論。此次培訓(xùn)使學(xué)員們不僅可以快速掌握單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的基本流程和技術(shù)，還熟悉了ViPMAP單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析平臺(tái)的使用，包括如何創(chuàng)建和提交分析任務(wù)、如何解讀分析結(jié)果等。這將進(jìn)一步提升學(xué)員們對(duì)所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心提供的常規(guī)生物信息分析服務(wù)的了解，為科學(xué)研究工作提供有力支持。
????營養(yǎng)與健康所所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心將持續(xù)舉辦相關(guān)主題的培訓(xùn)活動(dòng)，以幫助更多的科研人員了解中心提供的保全、保供、增值、定制等四類服務(wù)。同時(shí)，所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心還設(shè)計(jì)了相關(guān)的調(diào)研問卷（詳見文末二維碼），誠邀科研人員提出寶貴的意見和建議，以便進(jìn)一步優(yōu)化和提升服務(wù)質(zhì)量。通過與科研人員的積極互動(dòng)和反饋，中心將不斷改進(jìn)服務(wù)流程，提升技術(shù)支持質(zhì)量，為進(jìn)一步滿足科研需求提供更加優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。
黃俞瑋工程師作培訓(xùn)報(bào)告
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